Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cnn1Q08091 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms