Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Siah1bQ06985 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms