Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ascl1Q02067 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms