Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Hoxd1Q01822 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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