Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms