Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
PrcdQ00LT2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PrcdQ00LT2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms