Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Itga4Q00651 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms