Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Xrn1P97789 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrn1P97789 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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