Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms