Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vamp2P63044 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms