Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Snap25P60879 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Snap25P60879 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snap25P60879 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms