Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn18P56857 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn18P56857 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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