Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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