Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sh3bp1P55194 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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