Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Efnb1P52795 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms