Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TgfaP48030 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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