Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cdkn1bP46414 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms