Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tnfsf9P41274 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf9P41274 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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