Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpl28P41105 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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