Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtlP38585 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TtlP38585 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TtlP38585 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms