Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NapbP28663 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NapbP28663 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms