Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BgnP28653 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BgnP28653 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BgnP28653 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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