Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Hoxd12P23812 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd12P23812 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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