Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Eif3aP23116 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Eif3aP23116 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms