Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prim1P20664 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms