Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PdgfaP20033 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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