Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18524 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18524 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18524 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms