Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Irf1P15314 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Irf1P15314 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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