Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
DmdP11531 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DmdP11531 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
DmdP11531 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms