Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Hoxd4P10628 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hoxd4P10628 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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