Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
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P10404 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
P10404 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
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