Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms