Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lnx1O70263 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms