Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Edil3O35474 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Edil3O35474 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms