Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6401L7N2C0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms