Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm2888K7N746 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm2888K7N746 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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