Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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Cldn34c3J3QJW5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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Cldn34c3J3QJW5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cldn34c3J3QJW5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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