Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms