Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp9yF8VPU6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms