Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4933432K03Rik-203ENSMUST00000206276 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sfmbt2-203ENSMUST00000114862 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nckap5-202ENSMUST00000094609 2965 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Polr1b-202ENSMUST00000103205 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pter-201ENSMUST00000028063 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dlg2-202ENSMUST00000098308 2329 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm20394-201ENSMUST00000173304 942 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp383-201ENSMUST00000186475 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms