Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm8005F6YKY3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm8005F6YKY3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm8005F6YKY3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm8005F6YKY3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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