Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm17555F6U8B9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17555F6U8B9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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