Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atad2bE9Q166 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms