Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms