Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Phf11bB4XVQ1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Phf11bB4XVQ1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Phf11bB4XVQ1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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