Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms