Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms