Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Atp8b5A3FIN4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Atp8b5A3FIN4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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