Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms