Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc183A2AJB1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc183A2AJB1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc183A2AJB1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc183A2AJB1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms